メンバーID変更後もトーク履歴は保持されますか？

はい、保持されます。

※ただし、メンバー自体を「会社から削除」後に、同じIDで新たにメンバーIDを作成した場合はトーク履歴等のない全く新しいアカウントになりますので、ご理解のほどよろしくお願いいたします。